Palmtop tworzy parę ze zwykłym pecetem. Tylko po podłączeniu PDA do komputera można instalować programy i wykonywać wiele innych operacji. Choć palmtop jest samodzielnym urządzeniem, pełnię możliwości osiąga po podłączeniu do peceta. Dopiero po nawiązaniu komunikacji z komputerem można kopiować pliki pomiędzy PDA a pecetem, instalować programy w palmtopie, synchronizować pocztę, kontakty i kalendarz oraz wygodnie zarządzać PDA. Pocket PC można podłączyć do komputera na kilka sposobów. Najprostszym jest użycie kabla USB. To rozwiązanie jest uniwersalne – przez kabel można zarówno przesłać dane, jak i ładować baterię palmtopa. Można też połączyć się z pecetem bezprzewodowo – za pomocą Bluetooth. Jest to wygodne rozwiązanie, ale skonfigurowanie połączenia jest dość trudne. Stworzenie poprawnie działającego połączenia Bluetooth między pecetem a PDA wymaga skonfigurowania w komputerze oraz aplikacji. Funkcja synchronizacji kopiuje wybrane dane między pecetem a PDA i odwrotnie tak, aby na obydwu urządzeniach były one identyczne.